40S ribosomal protein S4, X isoform=Homo sapiens GN=RPS4X

AltitudeomicsDB
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Aliases RPS4X CCG2 RPS4 SCAR
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6222 (RPS18) 0.85 0.83 0.86 0.77 0.84 0.85 0.85 0.27 0.85 0.85 0.83 0.83 0.85 0.85 1.00 0.85 0.85 1.00 0.85 0.82 0.73 0.85 0.71 0.85 0.76 0.94 0.78 0.66 0.66 0.85 0.68 0.80 0.80 0.66 0.85 0.81 0.76 0.85 0.92 0.63 0.71 0.68 0.85 0.85 0.83 0.66 0.66 0.78 0.85 0.85 0.85
6122 (RPL3) 1.00 0.96 0.98 0.88 0.97 1.00 1.00 0.57 1.00 1.00 0.96 0.96 1.00 0.96 0.85 1.00 1.00 0.85 1.00 0.92 0.88 1.00 0.82 1.00 0.87 0.83 0.94 0.87 0.87 1.00 0.86 0.91 0.91 0.87 1.00 0.90 0.88 1.00 0.81 0.67 0.80 0.86 1.00 1.00 0.96 0.87 0.87 0.90 1.00 1.00 1.00
6207 (RPS13) 0.92 0.90 0.93 0.85 0.91 0.92 0.92 0.40 0.92 0.92 0.90 0.97 0.92 0.97 0.82 0.92 0.92 0.82 0.92 1.00 0.84 0.92 0.81 0.92 0.94 0.88 0.88 0.83 0.83 0.92 0.89 0.92 0.87 0.83 0.92 0.91 0.85 0.92 0.79 0.71 0.85 0.89 0.92 0.92 0.90 0.83 0.83 0.87 0.92 0.92 0.92
6128 (RPL6) 0.88 0.93 0.88 0.74 0.86 0.88 0.88 0.47 0.88 0.88 0.93 0.86 0.88 0.87 0.73 0.88 0.88 0.73 0.88 0.84 1.00 0.88 0.73 0.88 0.80 0.73 0.84 0.83 0.83 0.88 0.83 0.86 0.87 0.83 0.88 0.84 0.84 0.88 0.68 0.61 0.73 0.83 0.88 0.88 0.93 0.83 0.83 0.82 0.88 0.88 0.88
6210 (RPS15A) 1.00 0.96 0.98 0.88 0.97 1.00 1.00 0.57 1.00 1.00 0.96 0.96 1.00 0.96 0.85 1.00 1.00 0.85 1.00 0.92 0.88 1.00 0.82 1.00 0.87 0.83 0.94 0.87 0.87 1.00 0.86 0.91 0.91 0.87 1.00 0.90 0.88 1.00 0.81 0.67 0.80 0.86 1.00 1.00 0.96 0.87 0.87 0.90 1.00 1.00 1.00
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6189 (RPS3A) 0.83 0.81 0.84 0.76 0.82 0.83 0.83 0.24 0.83 0.83 0.81 0.90 0.83 0.86 0.94 0.83 0.83 0.94 0.83 0.88 0.73 0.83 0.71 0.83 0.82 1.00 0.77 0.67 0.67 0.83 0.73 0.82 0.79 0.67 0.83 0.82 0.76 0.83 0.89 0.64 0.77 0.73 0.83 0.83 0.81 0.67 0.67 0.77 0.83 0.83 0.83
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6141 (RPL18) 0.87 0.77 0.87 0.63 0.86 0.87 0.87 0.60 0.87 0.87 0.77 0.85 0.87 0.86 0.66 0.87 0.87 0.66 0.87 0.83 0.83 0.87 0.67 0.87 0.78 0.67 0.86 1.00 1.00 0.87 0.96 0.77 0.69 1.00 0.87 0.66 0.76 0.87 0.57 0.46 0.68 0.96 0.87 0.87 0.77 1.00 1.00 0.80 0.87 0.87 0.87
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6155 (RPL27) 1.00 0.96 0.98 0.88 0.97 1.00 1.00 0.57 1.00 1.00 0.96 0.96 1.00 0.96 0.85 1.00 1.00 0.85 1.00 0.92 0.88 1.00 0.82 1.00 0.87 0.83 0.94 0.87 0.87 1.00 0.86 0.91 0.91 0.87 1.00 0.90 0.88 1.00 0.81 0.67 0.80 0.86 1.00 1.00 0.96 0.87 0.87 0.90 1.00 1.00 1.00
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6147 (RPL23A) 0.91 0.96 0.91 0.84 0.90 0.91 0.91 0.46 0.91 0.91 0.96 0.89 0.91 0.90 0.80 0.91 0.91 0.80 0.91 0.87 0.87 0.91 0.79 0.91 0.83 0.79 0.84 0.69 0.69 0.91 0.70 0.86 1.00 0.69 0.91 0.91 0.84 0.91 0.77 0.67 0.78 0.70 0.91 0.91 0.96 0.69 0.69 0.85 0.91 0.91 0.91
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6232 (RPS27) 0.88 0.86 0.88 0.82 0.87 0.88 0.88 0.67 0.88 0.88 0.86 0.87 0.88 0.87 0.76 0.88 0.88 0.76 0.88 0.85 0.84 0.88 0.77 0.88 0.81 0.76 0.83 0.76 0.76 0.88 0.76 0.88 0.84 0.76 0.88 0.84 1.00 0.88 0.74 0.71 0.76 0.76 0.88 0.88 0.86 0.76 0.76 0.83 0.88 0.88 0.88
6124 (RPL4) 1.00 0.96 0.98 0.88 0.97 1.00 1.00 0.57 1.00 1.00 0.96 0.96 1.00 0.96 0.85 1.00 1.00 0.85 1.00 0.92 0.88 1.00 0.82 1.00 0.87 0.83 0.94 0.87 0.87 1.00 0.86 0.91 0.91 0.87 1.00 0.90 0.88 1.00 0.81 0.67 0.80 0.86 1.00 1.00 0.96 0.87 0.87 0.90 1.00 1.00 1.00
6194 (RPS6) 0.81 0.79 0.82 0.84 0.81 0.81 0.81 0.25 0.81 0.81 0.79 0.80 0.81 0.82 0.92 0.81 0.81 0.92 0.81 0.79 0.68 0.81 0.70 0.81 0.75 0.89 0.73 0.57 0.57 0.81 0.61 0.78 0.77 0.57 0.81 0.80 0.74 0.81 1.00 0.66 0.70 0.61 0.81 0.81 0.79 0.57 0.57 0.76 0.81 0.81 0.81
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11224 (RPL35) 0.86 0.77 0.86 0.65 0.85 0.86 0.86 0.50 0.86 0.86 0.77 0.88 0.86 0.91 0.68 0.86 0.86 0.68 0.86 0.89 0.83 0.86 0.68 0.86 0.81 0.73 0.85 0.96 0.96 0.86 1.00 0.82 0.70 0.96 0.86 0.72 0.76 0.86 0.61 0.49 0.73 1.00 0.86 0.86 0.77 0.96 0.96 0.80 0.86 0.86 0.86
6144 (RPL21) 1.00 0.96 0.98 0.88 0.97 1.00 1.00 0.57 1.00 1.00 0.96 0.96 1.00 0.96 0.85 1.00 1.00 0.85 1.00 0.92 0.88 1.00 0.82 1.00 0.87 0.83 0.94 0.87 0.87 1.00 0.86 0.91 0.91 0.87 1.00 0.90 0.88 1.00 0.81 0.67 0.80 0.86 1.00 1.00 0.96 0.87 0.87 0.90 1.00 1.00 1.00
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Association with High Altitude
Protein Official symbol Source Organism Tissue of Expression Level of hypoxia Altitude Duration of experiment Level of expression Fold change Experiment details geographical location ethnicity of the patients Control group Control (Fold change) Reference (PMID)
RPS4X Human Blood - 3600 m Native upregulated - TMT-based proteomic analysis/LC-MS Central Asia Tibetans - High altitude native vs. low Lander 30908922
Association with TF
TF TF Entrez Gene Gene Entrez Type PMID Database
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EP300 2033 RPS4X 6191 distal 22955619 TRANSFAC
TCF12 6938 RPS4X 6191 distal 22955619 TRANSFAC
RAD21 5885 RPS4X 6191 distal 22955619 TRANSFAC
JUND 3727 RPS4X 6191 distal 22955619 TRANSFAC
SP1 6667 RPS4X 6191 distal 22955619 TRANSFAC
NANOG 79923 RPS4X 6191 distal 22955619 TRANSFAC
TAF1 6872 RPS4X 6191 proximal_filtered 22955619 TRANSFAC
Association with miRNA
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MIRT047191 hsa-miR-182-5p Homo sapiens RPS4X 6191 Homo sapiens CLASH Functional MTI (Weak) 23622248
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MIRT049977 hsa-miR-29a-3p Homo sapiens RPS4X 6191 Homo sapiens CLASH Functional MTI (Weak) 23622248
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MIRT517853 hsa-miR-16-2-3p Homo sapiens RPS4X 6191 Homo sapiens PAR-CLIP Functional MTI (Weak) 23446348
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MIRT517844 hsa-miR-520d-5p Homo sapiens RPS4X 6191 Homo sapiens PAR-CLIP Functional MTI (Weak) 23446348
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Gene Ontology
ID GO ID GO Term GO Type
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6191 GO:0016020 membrane GOTERM_CC_DIRECT
Pathways
Human Entrez ID KEGG ID KEGG Term
6191 hsa03010 Ribosome
Association with Disease
Protein Official Symbol Human Entrez ID Disease Name Disease Id Disease Semantic Type Semantic score DSI DPI Disease Type
RPS4X 6191 Breast Carcinoma C0678222 Neoplastic Process 0.32 0.743 0.448 disease
RPS4X 6191 Mammary Neoplasms C1458155 Neoplastic Process 0.3 0.743 0.448 group
RPS4X 6191 Malignant neoplasm of breast C0006142 Neoplastic Process 0.31 0.743 0.448 disease
RPS4X 6191 Mammary Neoplasms, Human C1257931 Neoplastic Process 0.3 0.743 0.448 group
Association with Drug
Protein Official Symbol Human Entrez ID drug_claim_primary_name drug_name drug_chembl_id interaction_types