Claudin 6

AltitudeomicsDB
Protein Official symbol CLDN6
Aliases CLDN6 UNQ757/PRO1488
Chromosomal Location 16
Length 220
Uniprot ID P56747
EC number None
Protein family Information(Pfam) PF00822;
PDB id None
InterPro ID IPR006187;IPR003925;IPR017974;IPR004031;
dbSNP rs2257295

Protein Protein Interaction

0%
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AltitudeomicsDB
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CLDN7 CLDN22 0.9
Gene Ontology Semantic Similarity
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# 9069 (CLDN12) 26285 (CLDN17) 10686 (CLDN16) 51208 (CLDN18) 5010 (CLDN11) 9071 (CLDN10) 1366 (CLDN7) 49861 (CLDN20) 7122 (CLDN5) 1365 (CLDN3) 1364 (CLDN4) 24146 (CLDN15) 9074 (CLDN6) 9073 (CLDN8) 9076 (CLDN1) 23562 (CLDN14) 137075 (CLDN23) 53842 (CLDN22) 149461 (CLDN19) 9080 (CLDN9) 9075 (CLDN2)
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7122 (CLDN5) 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 0.13 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
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23562 (CLDN14) 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 0.13 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
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149461 (CLDN19) 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 0.13 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
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Association with High Altitude
Protein Official symbol Source Organism Tissue of Expression Level of hypoxia Altitude Duration of experiment Level of expression Fold change Experiment details geographical location ethnicity of the patients Control group Control (Fold change) Reference (PMID)
CLDN6 Human Blood - 3250 m 4 day upregulated 2.1396 Microarray Himalayas Indians 1 Sea level healthy individuals 24465776
CLDN6 Human Blood - 3250 m 4 day upregulated 2.1396 Microarray Himalayas Indians 1 Sea level healthy individuals 24465776
Association with TF
TF TF Entrez Gene Gene Entrez Type PMID Database
EP300 2033 CLDN6 9074 distal 22955619 TRANSFAC
TCF12 6938 CLDN6 9074 proximal_filtered 22955619 TRANSFAC
JUND 3727 CLDN6 9074 proximal_filtered 22955619 TRANSFAC
Association with miRNA
miRTarBase ID miRNA Species (miRNA) Protein Official Symbol Human Entrez ID Species (Target Gene) Experiments Support Type References (PMID)
Gene Ontology
ID GO ID GO Term GO Type
9074 GO:0042802 identical protein binding GOTERM_MF_DIRECT
9074 GO:0005198 structural molecule activity GOTERM_MF_DIRECT
9074 GO:0016032 viral process GOTERM_BP_DIRECT
9074 GO:0016327 apicolateral plasma membrane GOTERM_CC_DIRECT
9074 GO:0045216 cell-cell junction organization GOTERM_BP_DIRECT
9074 GO:0016338 calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules GOTERM_BP_DIRECT
9074 GO:0005923 bicellular tight junction GOTERM_CC_DIRECT
9074 GO:0016021 integral component of membrane GOTERM_CC_DIRECT
Pathways
Human Entrez ID KEGG ID KEGG Term
9074 hsa04514 Cell adhesion molecules
9074 hsa04530 Tight junction
9074 hsa04670 Leukocyte transendothelial migration
9074 hsa05160 Hepatitis C
Association with Disease
Protein Official Symbol Human Entrez ID Disease Name Disease Id Disease Semantic Type Semantic score DSI DPI Disease Type
Association with Drug
Protein Official Symbol Human Entrez ID drug_claim_primary_name drug_name drug_chembl_id interaction_types