ALTITUDEOMICSDB

Myosin-binding protein C

AltitudeomicsDB

Protein Official symbol	MYBPC2
Aliases	MYBPC2 MYBPCF
Chromosomal Location	19
Length	1141
Uniprot ID	Q14324
EC number	None
Protein family Information(Pfam)	PF00041;PF07679;PF18362;
PDB id	2E7C;2EDK;2EDN;
InterPro ID	IPR003961;IPR036116;IPR007110;IPR036179;IPR013783;IPR013098;IPR003599;IPR003598;IPR040849;
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Protein Protein Interaction

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AltitudeomicsDB

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NEB	MYH8	0.957
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MYBPC1	TPM1	0.927
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TCAP	TMOD1	0.924
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DES	DMD	0.921
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TNNI2	TNNI1	0.911
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TNNT1	TMOD3	0.91
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TMOD3	TNNC1	0.905
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7415 (VCP)	0.63	0.26	0.57	0.53	0.32	0.58	0.28	0.42	1.00	0.16	0.55	0.22	1.00	0.62	0.22	0.40	0.60	0.58	0.61	0.58	0.58	0.53	0.61	0.57	0.61	0.15	0.55	0.49	0.57	0.46	0.71	0.64	0.56	0.12	0.60	0.56	0.58	0.57	0.65	0.61	0.57	0.37	0.64	0.58	0.61	0.60	0.68
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4332 (MNDA)	1.00	0.16	1.00	0.82	0.48	1.00	0.42	0.42	1.00	0.18	0.82	0.14	1.00	1.00	0.14	0.61	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	0.82	1.00	1.00	1.00	0.19	1.00	0.69	1.00	0.69	1.00	1.00	1.00	0.12	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	0.42	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00
1075 (CTSC)	0.78	0.34	0.70	0.45	0.33	0.69	0.35	0.42	0.62	0.27	0.58	0.29	1.00	1.00	0.29	0.44	0.73	0.58	0.55	0.60	0.57	0.54	0.51	0.60	0.53	0.20	0.71	0.37	0.56	0.50	0.73	0.64	0.53	0.14	0.52	0.54	0.58	0.56	0.65	0.60	0.56	0.30	0.63	0.54	0.67	0.61	0.61
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1511 (CTSG)	0.86	0.48	0.87	0.39	0.50	0.84	0.40	0.42	0.55	0.37	0.55	0.43	1.00	0.71	0.43	0.44	0.78	0.53	0.50	0.52	0.46	0.49	0.49	0.62	0.46	0.24	1.00	0.27	0.43	0.49	0.63	0.51	0.44	0.21	0.46	0.45	0.46	0.46	0.55	0.49	0.43	0.30	0.57	0.46	0.68	0.47	0.48
6317 (SERPINB3)	0.40	0.13	0.37	0.28	0.20	0.33	0.17	0.29	0.49	0.11	0.33	0.11	0.69	0.37	0.11	0.22	0.36	0.33	0.34	0.31	0.34	0.27	0.41	0.30	0.36	0.13	0.27	1.00	0.32	0.28	0.49	0.39	0.30	0.09	0.43	0.30	0.33	0.32	0.45	0.37	0.32	0.18	0.41	0.31	0.35	0.39	0.36
4513 (MT-CO2)	0.58	0.16	0.47	0.44	0.36	0.54	0.29	0.42	0.57	0.16	0.56	0.14	1.00	0.56	0.14	0.39	0.60	0.53	0.53	0.52	0.58	0.48	0.53	0.50	0.51	0.24	0.43	0.32	1.00	0.48	0.61	0.68	0.49	0.12	0.48	0.54	0.58	0.47	0.68	0.63	0.56	0.33	0.65	0.52	0.55	0.65	0.63
51816 (CECR1)	0.56	0.34	0.47	0.39	0.30	0.54	0.33	0.45	0.46	0.22	0.54	0.30	0.69	0.50	0.30	0.60	0.58	0.58	0.52	0.63	0.67	0.50	0.40	0.52	0.44	0.17	0.49	0.28	0.48	1.00	0.55	0.54	0.46	0.17	0.41	0.46	0.50	0.45	0.52	0.67	0.48	0.25	0.55	0.47	0.66	0.50	0.58
29108 (PYCARD)	0.71	0.24	0.67	0.49	0.31	0.63	0.29	0.42	0.71	0.16	0.58	0.21	1.00	0.73	0.21	0.49	0.68	0.65	0.62	0.61	0.61	0.57	0.60	0.60	0.59	0.15	0.63	0.49	0.61	0.55	1.00	0.68	0.59	0.12	0.62	0.59	0.62	0.59	0.67	0.69	0.61	0.28	0.70	0.59	0.68	0.64	0.63
7276 (TTR)	0.65	0.16	0.53	0.50	0.37	0.61	0.34	0.42	0.64	0.16	0.62	0.14	1.00	0.64	0.14	0.49	0.68	0.63	0.58	0.63	0.67	0.67	0.55	0.59	0.58	0.17	0.51	0.39	0.68	0.54	0.68	1.00	0.60	0.12	0.53	0.61	0.69	0.57	0.75	0.73	0.68	0.34	0.73	0.62	0.62	0.76	0.73
47 (ACLY)	0.54	0.20	0.48	0.57	0.34	0.53	0.29	0.42	0.56	0.18	0.51	0.17	1.00	0.53	0.17	0.37	0.55	0.53	0.49	0.48	0.53	0.43	0.49	0.48	0.62	0.19	0.44	0.30	0.49	0.46	0.59	0.60	1.00	0.37	0.51	0.55	0.57	0.52	0.62	0.57	0.58	0.31	0.62	0.56	0.56	0.56	0.58
9 (NAT1)	0.15	0.14	0.21	0.12	0.18	0.21	0.14	0.08	0.12	0.17	0.14	0.12	0.12	0.14	0.12	0.14	0.12	0.22	0.18	0.14	0.12	0.14	0.15	0.17	0.15	0.18	0.21	0.09	0.12	0.17	0.12	0.12	0.37	1.00	0.22	0.14	0.24	0.29	0.12	0.12	1.00	0.14	0.12	0.21	0.34	0.12	0.12
5580 (PRKCD)	0.56	0.18	0.49	0.40	0.29	0.51	0.25	0.42	0.60	0.16	0.46	0.16	1.00	0.52	0.16	0.34	0.51	0.52	0.50	0.48	0.50	0.41	0.53	0.48	0.50	0.17	0.46	0.43	0.48	0.41	0.62	0.53	0.51	0.22	1.00	0.47	0.54	0.81	0.62	0.52	0.51	0.26	0.56	0.51	0.56	0.52	0.52
1727 (CYB5R3)	0.55	0.20	0.48	0.48	0.40	0.54	0.28	0.42	0.56	0.18	0.52	0.17	1.00	0.54	0.17	0.38	0.56	0.51	0.54	0.49	0.54	0.44	0.49	0.48	0.55	0.29	0.45	0.30	0.54	0.46	0.59	0.61	0.55	0.14	0.47	1.00	0.53	0.46	0.63	0.58	0.51	0.38	0.62	0.60	0.57	0.57	0.59
93100 (NAPRT)	0.60	0.20	0.49	0.45	0.35	0.56	0.31	0.42	0.58	0.20	0.57	0.17	1.00	0.58	0.17	0.41	0.61	0.63	0.52	0.54	0.59	0.51	0.50	0.53	0.52	0.22	0.46	0.33	0.58	0.50	0.62	0.69	0.57	0.24	0.54	0.53	1.00	0.56	0.69	0.64	0.62	0.32	0.66	0.64	0.61	0.66	0.64
5594 (MAPK1)	0.53	0.24	0.48	0.40	0.31	0.51	0.27	0.42	0.57	0.19	0.47	0.21	1.00	0.56	0.21	0.39	0.51	0.55	0.50	0.47	0.49	0.48	0.49	0.48	0.47	0.20	0.46	0.32	0.47	0.45	0.59	0.57	0.52	0.29	0.81	0.46	0.56	1.00	0.56	0.53	0.51	0.28	0.60	0.51	0.60	0.51	0.51
54472 (TOLLIP)	0.71	0.16	0.55	0.52	0.34	0.62	0.30	0.42	0.65	0.14	0.63	0.14	1.00	0.65	0.14	0.43	0.70	0.63	0.59	0.64	0.67	0.56	0.54	0.61	0.60	0.15	0.55	0.45	0.68	0.52	0.67	0.75	0.62	0.12	0.62	0.63	0.69	0.56	1.00	0.70	0.68	0.31	0.70	0.64	0.64	0.74	0.72
25801 (GCA)	0.62	0.16	0.51	0.48	0.34	0.58	0.30	0.42	0.61	0.14	0.58	0.14	1.00	0.60	0.14	0.74	0.64	0.74	0.62	0.68	0.83	0.56	0.53	0.56	0.56	0.16	0.49	0.37	0.63	0.67	0.69	0.73	0.57	0.12	0.52	0.58	0.64	0.53	0.70	1.00	0.63	0.31	0.73	0.59	0.66	0.69	0.67
10 (NAT2)	0.58	0.16	0.47	0.44	0.33	0.54	0.28	0.42	0.57	0.16	0.56	0.14	1.00	0.56	0.14	0.39	0.60	0.55	0.51	0.52	0.58	0.48	0.49	0.50	0.51	0.18	0.43	0.32	0.56	0.48	0.61	0.68	0.58	1.00	0.51	0.51	0.62	0.51	0.68	0.63	1.00	0.30	0.66	0.54	0.56	0.65	0.64
3614 (IMPDH1)	0.31	0.20	0.29	0.43	0.33	0.33	0.26	0.31	0.37	0.18	0.33	0.17	0.42	0.30	0.17	0.23	0.30	0.29	0.32	0.31	0.31	0.28	0.33	0.32	0.29	0.29	0.30	0.18	0.33	0.25	0.28	0.34	0.31	0.14	0.26	0.38	0.32	0.28	0.31	0.31	0.30	1.00	0.30	0.40	0.36	0.31	0.56
6386 (SDCBP)	0.66	0.16	0.57	0.51	0.35	0.63	0.31	0.42	0.64	0.13	0.60	0.14	1.00	0.63	0.14	0.47	0.69	0.67	0.60	0.63	0.65	0.58	0.64	0.61	0.60	0.15	0.57	0.41	0.65	0.55	0.70	0.73	0.62	0.12	0.56	0.62	0.66	0.60	0.70	0.73	0.66	0.30	1.00	0.64	0.64	0.69	0.68
5834 (PYGB)	0.55	0.17	0.49	0.49	0.38	0.55	0.28	0.42	0.58	0.17	0.53	0.15	1.00	0.54	0.15	0.39	0.56	0.61	0.49	0.50	0.55	0.45	0.52	0.48	0.53	0.19	0.46	0.31	0.52	0.47	0.59	0.62	0.56	0.21	0.51	0.60	0.64	0.51	0.64	0.59	0.54	0.40	0.64	1.00	0.56	0.59	0.64
2717 (GLA)	0.70	0.60	0.66	0.47	0.39	0.68	0.43	0.42	0.61	0.42	0.71	0.54	1.00	0.67	0.54	0.61	0.67	0.72	0.66	0.63	0.57	0.67	0.52	0.68	0.55	0.33	0.68	0.35	0.55	0.66	0.68	0.62	0.56	0.34	0.56	0.57	0.61	0.60	0.64	0.66	0.56	0.36	0.64	0.56	1.00	0.58	0.60
201294 (UNC13D)	0.64	0.16	0.50	0.48	0.34	0.58	0.30	0.42	0.60	0.15	0.60	0.14	1.00	0.61	0.14	0.42	0.66	0.58	0.54	0.59	0.64	0.54	0.57	0.55	0.56	0.16	0.47	0.39	0.65	0.50	0.64	0.76	0.56	0.12	0.52	0.57	0.66	0.51	0.74	0.69	0.65	0.31	0.69	0.59	0.58	1.00	0.71
2896 (GRN)	0.64	0.16	0.50	0.64	0.35	0.58	0.31	0.42	0.68	0.15	0.63	0.14	1.00	0.61	0.14	0.42	0.67	0.58	0.54	0.59	0.64	0.53	0.58	0.55	0.57	0.16	0.48	0.36	0.63	0.58	0.63	0.73	0.58	0.12	0.52	0.59	0.64	0.51	0.72	0.67	0.64	0.56	0.68	0.64	0.60	0.71	1.00

Association with High Altitude

Protein Official symbol	Source Organism	Tissue of Expression	Level of hypoxia	Altitude	Duration of experiment	Level of expression	Fold change	Experiment details	geographical location	ethnicity of the patients	Control group	Control (Fold change)	Reference (PMID)
MYBPC2	Toad	Heart	-	3464 m	33 day	downregulated	-2.923213663	RNA-seq	Tibetan Plateau	Asiatic toad	1	Zoige (High altitute Toad) Vs Chengdu (Low altitude toad) -	28673260

Association with TF

TF	TF Entrez	Gene	Gene Entrez	Type	PMID	Database
RFX5	5993	MYBPC2	4606	proximal_filtered	22955619	TRANSFAC

Association with miRNA

miRTarBase ID	miRNA	Species (miRNA)	Protein Official Symbol	Human Entrez ID	Species (Target Gene)	Experiments	Support Type	References (PMID)

Gene Ontology

ID	GO ID	GO Term	GO Type
4606	GO:0005515	protein binding	GOTERM_MF_DIRECT
4606	GO:0003779	actin binding	GOTERM_MF_DIRECT
4606	GO:0007155	cell adhesion	GOTERM_BP_DIRECT
4606	GO:0030049	muscle filament sliding	GOTERM_BP_DIRECT
4606	GO:0008307	lipid binding	GOTERM_MF_DIRECT
4606	GO:0005829	cytosol	GOTERM_CC_DIRECT
4606	GO:0006936	muscle contraction	GOTERM_BP_DIRECT
4606	GO:0032982	myosin filament	GOTERM_CC_DIRECT

Pathways

Human Entrez ID	KEGG ID	KEGG Term

Association with Disease

Protein Official Symbol	Human Entrez ID	Disease Name	Disease Id	Disease Semantic Type	Semantic score	DSI	DPI	Disease Type

Association with Drug

Protein Official Symbol	Human Entrez ID	drug_claim_primary_name	drug_name	drug_chembl_id	interaction_types